Три года минули со времени спасения виртуального пространства от угрозы, оставив после себя лишь воспоминания о прошлом событии. Пришло пора новому поколению избранных взять эстафету у предыдущих защитников и противостоять вновь возникшей угрозе миру. Им предстоят испытания стать могучими защитниками, противостоящими владыке дигимонов – существенной угрозе существованию вселенной. Злодей применяет уничтоженные дигимоны для осуществления своих зловещих планов. В связи с возникшей потребностью

События происходят в уникальной локации, именуемой «Акацуки». Внутри столицы Токио существует автономное образование, охваченное волнами хаоса, анархии и контрабандой оружия. Когда-то спокойный, но теперь предоставленный самому себе, этот участок превратился в арену противостояния крупных компаний, стремящихся захватить контроль над рынком через уличные столкновения, часто приводящие к несчастным случаям и трагическим последствиям среди мирного населения. В результате в заведении «Акацуки»

Два младших брата и сестра трудятся в компании, занимающейся поиском внеземных существ. В одном лесу путешественники обнаруживают инопланетный звездолёт и там знакомятся с существом, жаждущим освоить карточную игру Rush Duel. Житель далёкой звезды уверен, что данная игра способна предотвратить войну на его планете.