В ходе своего маршрута через область Джото группа Сатоши достигает Альтомара, прибрежного города, славящегося ежегодными водными соревнованиями под названием "Покемонские морские гонки". В то время как Такэси и Касуми проводят отпуск, Сатоши оказывается вовлечён в серию странных инцидентов: его побеждают в гонке, он наблюдает нападение на молодую женщину с использованием покемонов, а спасённая девушка отвергает знакомство с ним и Пикачем. События, озадачивающие Сатоши своей необычностью, быстро обретают ясность.

Оказалось, что освобожденная девочка на самом деле являлась существом под названием Латиас, способным принимать образ своей человеческой знакомой Канон. Латияс и его сородич Латиосс считаются Эоновыми существами, оберегая Альтомар под защитой загадочного синего шара, именуемого Душою Розы. Старая предание Альтомаре глубоко переплетена с мифическими существами Эон и Кристаллом Роса, о которой осведомлены местные жители, равно как и бандиты Заннер и Лион, стремящиеся завладеть этими сущностями и артефактом. Сатоши приходится вмешиваться, дабы избежать надвигающейся угрозы городу.